Voilà le problème :

Vous voulez mettre des droits en lecture uniquement sur tous les fichiers mais laisser le droit "x" sur les répertoires.

Voilà la solution la plus simple que j’ai décomposée volontairement pour être plus clair :

1. Supprimer toutes les autorisations :
   chmod -R 0 ./*
2. Ajouter les autorisations en lecture pour tout le monde :
   chmod -R ugo+r ./*
3. Ajouter les autorisations en écriture uniquement pour le possesseur des fichiers :
   chmod -R u+w ./*
4. Et la petite astuce pour que les autres puissent lire les répertoires et sous-répertoires :
   Appliquer le "x" uniquement sur les répertoires et sous répertoires (et pas sur les fichiers) :
   find . -type d | xargs chmod ugo+x

En résumé, copiez collez cette ligne :
chmod -R 0 ./* && chmod -R ugo+r ./* && chmod -R u+w ./* && find . -type d | xargs chmod ugo+x

Et vous aurez pour tout le monde le droit en lecture des répertoire et sous répertoires et le droit en écriture uniquement donné à l’utilisateur courant.
Attention : il n’y aura pas de fichier exécutable, car les autorisations "x" seront enlevées.